Обновить визуализацию графа заметок: заменить библиотеку на ForceGraph и улучшить обработку данных. Восстановить генерацию graph.json с узлами и рёбрами между заметками.

_plugins/note_graph.rb

@@ -0,0 +1,108 @@
+# _plugins/note_graph.rb
+# Генерирует /graph.json с узлами и рёбрами между заметками из коллекции :notes.
+# Понимает [[target]], [[target|alias]], вложенные папки, alias'ы во front matter:
+# aliases: ["Короткое имя", "Другое имя"]
+
+require "json"
+
+module NoteGraph
+  class Generator < Jekyll::Generator
+    safe true
+    priority :low
+
+    WIKI_RX = /\[\[([^\]|#]+)(?:#[^\]|]+)?(?:\|[^\]]+)?\]\]/.freeze
+
+    def generate(site)
+      notes = (site.collections["notes"]&.docs || [])
+      return if notes.empty?
+
+      # Карта идентификаторов заметок -> объект
+      # id = относительный путь внутри _notes без расширения, в нижнем регистре
+      index = {}
+      aliases = {}
+
+      notes.each do |doc|
+        id = norm_id(doc.relative_path) # напр. "it-school/04-auto"
+        index[id] = {
+          "id"    => id,
+          "title" => (doc.data["title"] || File.basename(id)),
+          "url"   => doc.url
+        }
+
+        # поддержка front matter aliases
+        Array(doc.data["aliases"]).each do |al|
+          aliases[norm_key(al)] = id
+        end
+
+        # ещё можно сопоставлять обычное название файла без папок
+        base = File.basename(id)
+        aliases[norm_key(base)] = id
+      end
+
+      # Узлы
+      nodes = index.values
+
+      # Рёбра
+      links = []
+
+      notes.each do |doc|
+        src = norm_id(doc.relative_path)
+        content = doc.content.to_s
+
+        content.scan(WIKI_RX).each do |m|
+          raw = m.first # то, что внутри [[ ... ]]
+          # цель без якоря/алиаса и расширения
+          target = raw.strip
+          target = target.sub(/\|.*/, "")      # отрезать |alias
+          target = target.sub(/#.*/, "")       # отрезать #heading
+          target = target.sub(/\.md$/i, "")    # убрать .md
+
+          # 1) прямое совпадение по относительному пути
+          dst = index[norm_id("_notes/#{target}.md")]&.dig("id")
+          # 2) совпадение по alias/названию файла
+          dst ||= aliases[norm_key(target)]
+          next unless dst && index[dst]
+
+          links << { "source" => src, "target" => dst }
+        end
+      end
+
+      data = { "nodes" => nodes, "links" => links }
+
+      site.static_files << GeneratedJson.new(site, data)
+    end
+
+    # нормализуем «ключ»
+    def norm_key(s)
+      s.to_s.downcase.strip.gsub("\\", "/")
+    end
+
+    # делаем id из относительного пути документа
+    # "_notes/IT-School/04-auto.md" -> "it-school/04-auto"
+    def norm_id(relative_path)
+      p = relative_path.to_s
+      p = p.sub(%r!^_notes/!i, "")
+      p = p.sub(/\.md$/i, "")
+      p.downcase
+    end
+
+    # Объект статического файла, который кладём в _site/graph.json
+    class GeneratedJson < Jekyll::StaticFile
+      def initialize(site, data)
+        @site = site
+        @base = site.source
+        @dir  = "/"
+        @name = "graph.json"
+        @data = data
+        super(site, @base, @dir, @name, nil)
+      end
+
+      def write(dest)
+        dest_path = Jekyll.sanitized_path(dest, @dir, @name)
+        FileUtils.mkdir_p(File.dirname(dest_path))
+        File.write(dest_path, JSON.pretty_generate(@data))
+        true
+      end
+    end
+  end
+end